۱۲ دی ۱۴۰۴
به روز شده در: ۱۲ دی ۱۴۰۴ - ۰۹:۵۱
فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

پربیننده ترین پست همین یک ساعت اخیر
برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
نماینده مجلس: بیش از ۱۰۰ نماینده پای سؤال از رئیس‌جمهور ایستاده‌اند بنک هاوس؛ نمونه ای از معماری بروتالیسم اروپایی (+عکس) ادعای الجزیره: ژنرال‌های بشار اسد ۱۶۸ هزار جنگجو در اختیار دارند انجمن اهدای عضو: نشان اهدای عضو روی گواهینامه فقط اعلام تمایل است نه اهدای قطعی بازتعریف نقش ستون در معماری مدرن؛ نگاهی به پروژه مفهومی «ویلا T8» (+عکس)  محکومیت تعمیرکار خودرو در ابوظبی به پرداخت ۳۲ هزار درهم به دلیل تعمیر ناقص موتور هر چه عراقچی، تکراری و ملال‌آور، ظریف تازه و هیجان‌آور! آیت‌الله نوری همدانی: مردم از گرانی به ستوه آمده اند؛ سختی معیشت کمر مردم را خم کرده آمریکا 4 شرکت در امارات را تحریم کرد ورزش کنیم یا بخوابیم؟ هشدار شرکت گاز به ادارات: دمای بالاتر از ۲۰ درجه، مشمول قطع گاز وام بانکی یا دام کلاهبرداری؟ ابو نوح بازداشت شد «بهروز وثوقی» با عبا و عرقچین در تئاتر مدرسه؛ دهۀ 30 (عکس) چرا هنگام به خواب رفتن حس می‌کنیم درحال سقوط هستیم؟